A palavra transgénero está dicionarizada quer como adjetivo quer como substantivo. Como adjetivo, não parece haver consenso claro quanto à possibilidade da sua flexão no plural.
Os dicionários em linha elaborados em mantidos em Portugal – o da Infopédia e o Priberam – concordam quanto a classificar transgénero como adjetivo invariável: «pessoas/indivíduos trangénero». No entanto, em dicionários do mesmo tipo produzidos no Brasil, a informação lexicográfica associada sugere que o uso adjetival permite a flexão no plural: «pessoas/indivíduos trangêneros».
Quando empregada como substantivo, a palavra tem plural: «o/a transgénero», «os/as transgénero».