Independência é uma palavra derivada, por prefixação, de dependência: in- + dependência → independência.
Quanto a dependência, é esta uma palavra derivada por sufixação, tendo como base depende-, tema do verbo depender: depende- + -ncia → dependência.
Note-se que o sufixo -ncia tem um acento associado que recai não no próprio sufixo mas na vogal do tema que serve de base da derivação: depende- + -(ˆ)ncia → dependência.
O nome independência não se configura, portanto, como um caso de ambiguidade estrutural, porque não é possível isolar o tema "independe-" de um hipotético verbo *"independer" (o * indica que é verbo que não se usa).
Diferente é a situação de infelizmente, que pode efetivamente ser analisado de duas maneiras:
a) palavra derivada de felizmente, por prefixação;
b) palavra derivada de infeliz, por sufixação.
Importa realçar, porém, que infelizmente não é uma palavra derivada simultaneamente por prefixação e sufixação, visto que a derivação se faz sempre por fases sucessivas quer na analise indicada em a), quer na análise em b):
INFELIZMENTE
Análise a) – 1.ª derivação: feliz + -mente → felizmente; 2.ª derivação: in- + felizmente → infelizmente
ou
Análise b) – 1.ª derivação: in- + feliz → infeliz; 2.ª derivação: infeliz + -mente → infelizmente
É, pois, necessário reiterar que não há palavras derivadas por prefixação e sufixação. O que existe são palavras derivadas por sufixação ou palavras derivadas por prefixação, as quais podem ter como base radicais e temas ou, ainda, palavras que já eram também derivadas (caso de felizmente, que dá infelizmente).
Se a prefixação e a sufixação se dão na mesma fase de derivação, falamos, sim, de parassíntese (ver Textos Relacionados), um tipo de derivação que quase só ocorre na formação de verbos: a- + dorm- + -ecer → adormecer.
1 Sobre nomes que derivam de temas de verbos (nomes deverbais), recomenda-se a consulta da Gramática do Português, 2013-2020, pp. 3074/3075.