"Uma pequena paquiderme" sugere que paquiderme é feminino, o que não é sustentado pela norma padrão do português, pois paquiderme constitui um substantivo epiceno, i.e., «designa um ser animado não humano e que possui apenas um género, independentemente do sexo da entidade referida» (Infopédia). 

De facto, os dicionários registam paquiderme apenas como substantivo masculino. Isto significa que, embora possa designar tanto um macho como uma fêmea desse grupo de animais (elefante, rinoceronte, hipopótamo, etc.), a palavra mantém sempre a flexão gramatical masculina.

Assim, a forma correta é «um pequeno paquiderme», mesmo que estejamos a falar de uma elefanta. Constitui caso idêntico a outros substantivos masculinos epicenos ou comuns, que não variam em função do sexo do animal: por exemplo, dizemos «um crocodilo» ou «um gorila», independentemente de se tratar de macho ou fêmea.

Se for relevante assinalar o sexo do espécime, a norma prevê que se acrescente macho ou fêmea: «um pequeno paquiderme fêmea».