Ambas as formas são possíveis.
O advérbio abaixo pode ser usado com o valor de “em lugar inferior” (Priberam), sendo sinónimo de infra e antónimo de acima ou supra.
Por seu turno, a locução «em baixo» poderá ser usada com o valor de «numa posição ou num nível inferior» (Priberam), tendo como locução de valor contrário «em cima».
As possibilidades significativas de abaixo e de «em baixo» permitem-nos concluir que ambas poderão ser usadas no contexto em que o consulente refere, ou seja, para indicar um documento que se encontra numa posição / nível inferior.
Não obstante, os usos parecem preferir a construção «e-mail abaixo», tal como nos indica uma pesquisa no Corpus do Português, de Mark Davies, onde se registam 194 ocorrências da expressão «e-mail abaixo» face a 0 ocorrências de «e-mail em baixo» (usos da web e dialetos).
Disponha sempre!