Não temos indicação do quadro no qual se deve processar a interpretação das frases apresentadas, pelo que nos cingiremos a uma análise no quadro da articulação entre orações.
Neste plano, na frase (1), a oração «pois não paras de espirrar» é uma oração coordenada explicativa que justifica a afirmação «Estás constipado»:
(1) «Estás constipado, pois não paras de espirrar.»
Assim sendo, a oração coordenada explicativa não é uma causa da primeira oração, ou seja, espirrar não provoca uma constipação. Esta oração explicativa vem justificar afirmação «Estás constipado».
Em (2), a oração «pois estava constipado» é uma oração subordinada adverbial causal:
(2) «Ele espirrava muito, pois estava constipado.»
Neste caso, a oração subordinada é apresentada como uma causa para o facto de espirrar muito. Ou seja, no mundo tal como o conhecemos a constipação pode ser a causa dos espirros.
No âmbito desta interpretação, poderemos afirmar que a inferência / a conclusão presente na frase (1), «Estás constipado», pode ser falsa, ao passo que na frase (2) ambas as orações são dadas como verdadeiras.
Disponha sempre!