Lê-se no Acordo Ortográfico de 1990 (Base IX, ponto 2, alínea a) que recebem acento agudo «as palavras paroxítonas que apresentam na sílaba tónica as vogais abertas grafadas a, e, o e ainda i ou u e que terminam em -l, -n, -r, -x e -ps, assim como, salvo raras exceções, as respetivas formas do plural, algumas das quais passam a proparoxítonas»1.
Estando próton e elétron incluídas nesta categoria, então são palavras que se acentuam com acento agudo na penúltima sílaba2. Os respetivos plurais, prótons e elétrons, podem também ter formas proparoxítonas, prótones e elétrones, como se regista nos dicionários Dicionário Houaiss da Língua Portuguesa e no dicionário Michaelis.
1 Disponível no Portal da Língua Portuguesa e no Novo Acordo Ortográfico da Língua Portuguesa (Paulo Feytor Pinto, Impressa Nacional Casa da Moeda, 2009).
2 Estes termos, utilizado nos estudo da física, com a grafia apresentada pelo consulente, são comuns em português do Brasil. No entanto, em português de Portugal as formas e grafias que prevalecem são distintas e, por isso, também o seu plural é distinto: com efeito temos protão e eletrão, que pluralizam, respetivamente, como protões e eletrões.
