As pronúncias descritas pelo consulente existem e não são sentidas como incorretas, pois fazem parte da norma-padrão.
A pronúncia "compriender"1 é, em Portugal, a indiscutivelmente correta da palavra compreender.
Quanto a cooperação, em Portugal, pode soar "cuuperação" – com u repetido, sendo o primeiro uma semivogal –, forma que se simplifica e chega a "cuperação", apenas com um [u] articuladado, que é pronúncia até predominante2. São ambas variantes correntes e corretas.
Em nome do Ciberdúvidas, agradeço as palavras finais de apreço.
1 Transcrição fonética: [kõpɾjẽˈdeɾ] (Vocabulário Ortográfico do Português). A semivocalização de e antes de qualquer vogal (átona ou tónica), incluindo e, é fenómeno bem conhecido, que se refere na descrição da fonética e fonologia do português contemporâneo. Ler "Ditongos crescentes e glides em português".
2 Transcrição fonética: [kupɨɾɐˈsɐ̃w] (ibidem).