Pelo que pude observar no Dicionário Houaiss da Língua Portuguesa, na sua edição brasileira, o antepositivo tetra usa-se sem hífen; se o elemento que se lhe segue é escrito com h inicial, suprime-se esta letra, como acontece em tetraidrocanabinol, formado por tetra + hidro + canabinol. Contudo, o Grande Dicionário da Língua Portuguesa, de José Pedro Machado, indica que, em termos da química, o elemento tetra se usa com hífen antes de vogal e h.
Quanto aos outros elementos, o Dicionário Houaiss mostra que metileno também não é hifenizado como mostra a palavra metilenodioximetanfetamina; e hidro só o é, se for seguido de palavra começada por h: hidro-halloysita (ou hidro-haloisita). O dicionário de José Pedro Machado não regist[r]a formas com h que permitam confirmar ou contrariar o Dicionário Houaiss.
Parece-me, pois, que há duas formas possíveis, de acordo com os dicionários consultados: metilenotetraidrofolato e metilenotetra-hidrofolato.