Tem razão a consulente na observação que faz. Com a formulação apresentada, a interpretação do texto encontra uma zona de difícil interpretação, que seria importante clarificar.
O texto em questão cria uma rede de coesão lexical em torno do referente Rui, relativamente ao qual define uma rede de parentesco: pais, avós e duas irmãs mais velhas. Nesta linha, quando se apresenta o sintagma nominal «a minha irmã mais nova», a rede de sentidos apontará para Rui, tomado como referente (o que é reforçado pelo uso do determinante possessivo minha, que assume uma relação de coesão referencial). Assim, a leitura preferencial deste sintagma será «a irmã é mais nova do que o Rui» ou «o Rui é mais velho do que a irmã». Ora, este facto vem criar um ponto de incoerência com o sintagma «as minhas duas irmãs mais velhas», uma vez que este sintagma ativou a leitura «as irmãs são mais velhas do que o Rui» ou «o Rui é o mais novo dos irmãos».
Seria possível resolver esta ambiguidade encontrando outra forma de referir a irmã dita mais nova, introduzindo, por exemplo, os nomes próprios no início do texto ou fazendo uma referência à idade das duas irmãs.
Disponha sempre!