Quando usado com o sentido de «junção entre duas ou mais coisas» ou «aquilo que serve para ligar; ligamento» (cf. Dicionário Houaiss da Língua Portuguesa), o nome ligação pode ser usado com as preposições de e com:
(1) «A ligação da margem esquerda com a margem direita»
Neste sentido, será lícita a construção com o verbo estabelecer:
(2) «Estabelecer ligação da margem esquerda com a margem direita»
Por outro lado, em termos gerais, o valor da preposição com «é o de (co)presença (de duas entidades)» (Paiva Raposo et al., Gramática do Português. vol. II, Fundação Calouste Gulbenkian, p. 1557), o que parece apontar para a possibilidade de utilização com a expressão estabelecer ligação se o sentido for o de «criar ligação de X com Y», ou seja, entre duas entidades.
Acresce, ainda, que, o Dicionário de Regimes de Substantivos e Adjetivos, de Francisco Fernandes, regista a possibilidade de o verbo ligar ter associada a preposição com (para além, naturalmente, da preposição a), o que, por extensão, pode ser aplicável ao nome ligação.
N.E. – Os nossos agradecimentos ao consulente pelos cumprimentos ao trabalho do Ciberdúvidas.