A palavra sub-repção é «ato de conseguir uma graça, favor, privilégio etc., escondendo intencionalmente qualquer fato ou circunstância que, sendo expressos, constituiriam razão suficiente para a não-concessão» ou «ato de conseguir uma graça ou um benefício por meios sub-reptícios ou usando de mentiras» (exemplo: «só conseguiu o benefício por s[ub-repção]»); trata-se ainda de «ato ou efeito de furtar; subtração, furto».
Este substantivo (nome) vem do «lat[im] subreptĭo,ōnis, "velhacada, logro, dolo, fraude, engano, furto; ato de entrar às escondidas"; (...); f[orma] hist[órica] 1573 sorreyçam, 1720 subrepçaõ, 1789 subrepção».
Quanto a ob-repção, significa «ação de ocultar a verdade, de dissimular um fato para obter qualquer coisa»; deriva de «obreptĭo,ōnis, "ação de surpreender, surpresa", do rad[ical] de obreptum, sup[i]n[o] de obrēpo,is,ĕpsi, eptum,epĕre, "introduzir-se às escondidas, furtivamente, insinuar-se, chegar-se pouco a pouco a alguém; enganar, lograr, iludir"; (...); f[orma] hist[órica] sXV orreição, 1573 obreyçã, 1720 obrepção».
O advérbio sub-repticiamente quer dizer «de modo sub-reptício, furtivo ou ilícito»; por sua vez, ob-repticiamente significa «de um modo ob-reptício»; e este quer dizer «que foi obtido por ob-repção» e «Em que se usou astúcia, ardil, com o fim de obter algo».
Note-se que o novo acordo ortográfico (AO 1990) mantém o hífen nas palavras com os prefixos sub- e ob-.
Em conclusão, a sinonímia entre estas palavras é notória.
[Fontes: Dicionário Eletrônico Houaiss e Aulete Digital]