A palavra desidentificação significa «ato ou efeito de desidentificar(-se)»; por sua vez, desidentificar quer dizer «desfazer ou perder a identidade, a semelhança, a afinidade; dessemelhar(-se), desigualar(-se), divergir». Assim, existiu «um longo processo de perda da semelhança e da afinidade entre os interesses dos colonos e os das autoridades metropolitanas e seus representantes na colônia»; ou melhor: desidentificaram-se, divergiram.
Agora, respondendo directamente à sua pergunta, o termo desidentificação está correcto.
[Fonte: Dicionário Eletrônico Houaiss]