É verdade que o Michaelis — Moderno Dicionário da Língua Portuguesa indica que pijama é um substantivo dos dois géneros. O mesmo diz o Dicionário Aurélio XXI. Não me foi possível encontrar explicação para o uso no feminino: será resultado da terminação da palavra em -a, que é, como se sabe, a marca típica desse género em português? Seja como for, Maria Helena de Moura Neves, no seu Guia de Uso do Português — Confrontando regras e usos, afirma que só no masculino encontra usos de pijama, apesar do que estipulam alguns dicionários.