É mesmo o termo adequado, atendendo à sua definição por Margarita Correia e Lúcia San Payo de Lemos, em Inovação Lexical em Português (Lisboa, Edições Colibri/Associação de Professores de Português, 2005, pág. 83):
«amálgama: palavra resultante da junção de pares de outras palavras, normalmente construída de forma consciente, resultando de criatividade. Ex.: credifone.»
Aparentemente, dado que se trata da designação de uma empresa instituída pela Câmara Municipal de Vila Nova de Gaia, é natural que se recorra a uma denominação criativa, mediante a junção de um topónimo, Gaia, e um latinismo anima, «alma».
Mas neste caso, também se pode usar o termo tradicional aglutinação, visto estarmos perante a fusão de duas palavras: Gaianima.
O encontro de duas letras iguais é, na verdade, a fusão de dois sons e chama-se crase, conforme se confirma no Dicionário Houaiss:
«fusão de duas vogais idênticas numa só, que ocorre, p. ex.:, na evolução das línguas român[icas] (p. ex.: lat[im] colore "cor" > português coor > cor).»