A alternativa dada como certa, e bem, é a D não por causa do uso de pois em contraponto com portanto, mas, sim, devido à utilização de mas em vez de embora.
Na frase que apresenta será {#correcto|correto} usar portanto ou pois na terceira lacuna, uma vez que ambas as conjunções são, como disse o consulente, conclusivas e podem ser usadas nos mesmos contextos.
No entanto, na segunda lacuna deve ser usada a conjunção adversativa mas e não a conjunção concessiva embora, visto que o verbo da oração principal («serão contempladas em diferentes proporções») está no presente do indicativo. Para usar embora, este verbo teria de estar no presente do conjuntivo [subjuntivo]. Teria então a frase {#correcta|correta}: «embora as demais regiões também sejam contempladas em diferentes proporções».