Encontra-se a resposta na página 414 da Gramática da Língua Portuguesa Padrão, de Amini Boainain Hauy. Diz a autora: «Virgulam-se os advérbios sim e não quando empregados para responder a uma pergunta, confirmar ou enfatizar uma ideia.»
Assim, a vírgula é obrigatória em frases como as trazidas pelo consulente («Não vejo problema em discutir o tema, não»; «Não há problema nisso, não»), pois seu papel é marcar a ênfase do advérbio duplicado na frase.
Sempre às ordens!
