Neste contexto, vaga quer dizer «lugar, espaço que não se encontra ocupado e pode vir a sê-lo», a exemplo de «havia muitas v[agas] na garagem» e «no Verão, os hotéis ficam sem v[agas]». Por sua vez, remanescente significa «que ou o que remanesce, que sobeja, que resta». Assim, pode dizer, por exemplo, «Abriram novas vagas para técnico de informática na tua empresa?», e a resposta pode ser esta: «Não, temos apenas as vagas remanescentes.»

Também me parece correcto o seu exemplo: «Prazo de inscrição: até dia 17 de Setembro, para eventuais vagas remanescentes.»

[Fonte: Dicionário Eletrônico Houaiss]