Imagino que a sua preocupação seja saber se há explicação para o facto de haver pronúncias diferentes em espaços geográficos diferentes, ainda que sujeitos a uma mesma norma, ao mesmo tempo que espaços geográficos diferentes e sujeitos a normas diferentes apresentam semelhanças.
Importa desde já salientar que qualquer resposta dada neste espaço será sempre, necessariamente, breve e incompleta, dada a dimensão e a complexidade do tema, não esgotável, estou certa, numa tese de doutoramento.

A escrita e as suas convenções uniformes e veiculadas pelo sistema de ensino diluem, no papel, o que na oralidade continua (felizmente!) a verificar-se: a diversidade na pronúncia.

Esta variedade, em Portugal, prende-se com as características acumuladas ao longo dos tempos numa dada região e que são fruto das línguas que aí se falavam antes da generalização do latim e antes da (ou durante a) transformação deste na língua portuguesa. As línguas em presença e a sua interacção fazem com que o resultado final – ou seja: a língua que se vai harmonizando, uniformizando e desenvolvendo – seja diferente de região para região, havendo, todavia, semelhanças que permitem que todos nos estendamos e que possa dizer-se que falamos a mesma língua.

Da mesma forma que a evolução do latim para o português foi marcada pelo modo como em cada região se falava, também o crescimento do português no Brasil sofreu a influência das língua nativas, por um lado, e das comunidades portuguesas que povoaram cada região, bem como de todas as comunidades que, posteriormente, se fixaram aí.

Não conheço as diferentes pronúncias características do português do Brasil, mas, pelo quem me é dado saber, há, em muitos locais, pronúncias que em Portugal são mais características de uma ou de outra região, o que poderá explicar-se pela presença mais marcante de colonos dessas regiões no novo espaço linguístico. A esse aspecto há, sempre, que associar as novas oportunidades de evolução da língua, provocadas pelas características globais da comunidade que interage para, numa dada região, fazer crescer e mudar a sua língua.