À primeira vista, eu diria que estrupo é deturpação de estupro e, como tal, aparece por lapso no Vocabulário Ortográfico da Língua Portuguesa (VOLP) da Academia Brasileira de Letra (o VOLP da Porto Editora também acolhe as duas entradas). Além disso, consultei vários dicionários (Houaiss, Priberam, Porto Editora, Academia das Ciências de Lisboa), sem que estrupo conste em nenhum deles. Contudo, foi no Aulete Digital que dei com o substantivo masculino estrupo, com o significado de «tropel, tumulto, ruído», sinónimo de estrupido.

Em conclusão, encaro estrupo como palavra legítima, apesar de escassamente atestada, e parónima de estupro. E concordo com o consulente quanto à necessidade de uma advertência que assinale este caso de paronímia nos vocabulários ortográficos mencionados.