No contexto em causa, as duas frases são possíveis, com uma ligeira diferença de significação. 

O substantivo proteção pode fazer-se acompanhar de diferentes preposições, consoante o contexto ou o objetivo do enunciador. A preposição de une o nome ao seu complemento [«proteção» é o nome e «dos direitos autorais» é o complemento do nome] e estabelece, neste caso, uma ligação da ação [a proteção, o ato de proteger] que é desenvolvida em relação a algo: dos direitos autorais. Exprime claramente a noção de quem é o detentor/possuidor da proteção.

Mas, se se quiser vincar para quem se destina a proteção, poder-se-á dizer: «o problema da proteção aos direitos autorais» [a proteção «dirige-se para os direitos autorais» - ou «tem como finalidade os direitos autorais»]. Nesta situação, está bem marcada a ideia de fim, objetivo. Sobre este assunto, pode certificar-se na Nova Gramática do Português Contemporâneo, Celso Cunha e Lindley Cintra, Lisboa, Edições João Sá da Costa, 13.ª edição, 1997, página 558.

Porém, como se disse em cima, o termo proteção também pode vir acompanhado de outras preposições. Por exemplo:

– «Quero proteção ao administrador.»

– «Desejo proteção para o presidente.»

– «Tenho proteção contra os mosquitos.»

– «Ele tem a proteção devida, perante tantos perigos.»

– «Ela está sob proteção.»  

No caso da utilização da preposição a na expressão «o problema da proteção aos direitos autorais», esta pode ser utilizada:

♦ Quando o vocábulo tem o sentido de defesa, dedicação pessoal, cuidado. 

Ex: «Passou a mão pelos cabelos loiros do menino , num impulso de proteção àquele anjinho»

– regida, por exemplo, por verbos volitivos* [quero/desejo/exijo/ordeno/proponho, etc];

Exemplos:

– «Proponho proteção ao ministro.»

– «Quero proteção à vítima.»

– «Ordeno proteção ao aluno.»

– «Desejo proteção às instalações.»   

♦ Quando proteção tem o sentido de abrigo, amparo, resguardo.

Ex: «Não respeitaram o dever de proteção aos feridos.»

♦ Quando o termo tem o significado de tratamento privilegiado.

Ex: «O coronel sempre deu proteção ao Conselheiro fornecendo-lhe gado de graça»**.

♦ Quando regida por verbos com o significado de dar, oferecer, ceder, ofertar, fornecer.

Ex: «A polícia dá proteção à instituição bancária», entre outros exemplos.

 * verbos que exprimem a vontade do enunciador.

** Alguns exemplos foram tirados do Dicionário UNESP do Português Contemporâneo, organização de Francisco S. Borba, Editora UNESP, 2004.