O contexto não é adequado ao verbo favorecer; pode dizer, por exemplo, «o João favorecia o amigo, ajudando-o nos trabalhos da escola», «o professor favoreceu o José, ao atribuir-lhe uma classificação que ele não merecia», «o Fernando, em qualquer conflito, favorecia sempre o irmão mais novo», «favoreceu o amigo ao falar das qualidades dele», etc.
Nesta situação, parece-me preferível o verbo estimular («dar incentivo a; despertar o ânimo, o interesse, o brio de; encorajar, incentivar»), e a frase ficaria mais ou menos assim: «Professor, para estimular os alunos a construírem uma história pessoal de leitura...»
Por outro lado, «para favorecer que os alunos...» não tem sentido, porque o verbo favorecer não selecciona orações subordinadas completivas.