Nos dicionários consultados não há registo de nenhum substantivo que, em português, esteja na origem do adjetivo atónito. Na verdade, atônito (na variante do português do Brasil) ou atónito (na variante europeia) tem origem no latim attonìtus, a, um («assustado pelo ruído do trovão» e, por extensão semântica, «amedrontado, maravilhado»), particípio passado de attonare, «fazer o ruído do trovão, surpreender, atemorizar» (Dicionário Eletrônico Houaiss, edição de 2001).
Refira-se que atonia e atónico são termos científicos formados por elementos gregos. Atonia, que significa «perda do tónus» e «abatimento moral e/ou intelectual; inércia», é adaptação do grego atonía, as, «relaxamento, enfraquecimento» (ibidem). Atónico, «relativo a atonia», é adjetivo derivado do radical aton-, de atonia.