1. O verbo converter, com o sentido de «transformar uma coisa noutra», usa-se com a preposição em. Ex.: «Os trabalhadores profanaram a Capela de Santa Catarina, em Goa, convertendo-a em cozinha.» O verbo, conjugado reflexamente, pode reger a preposição a. Ex.: «converteu-se ao catolicismo».
2. Em ambas as sequências apresentadas, parece-nos que falta algo. Na 1.ª frase, cremos que falta o artigo a: «... alterar a função de determinado assunto.»
Mas pode-se alterar a função dum assunto? Não nos parece.
Poder-se-ia alterar a função dum aparelho ou dum objecto (ou, até, duma pessoa, num contexto profissional).
Na 2.ª sequência, deveria constar o objecto directo (alterar algo). Assim: «alterar algo em função de determinado assunto.»
Como desconhecemos o contexto em que o consulente inclui as frases, deixamos ambas as possibilidades.