O plural de mapa síntese é, como bem disse, mapas síntese. Trata-se de um termo composto por dois substantivos, em que o segundo especifica o primeiro. Assim, só o primeiro é que vai para o plural.
Num termo constituído por dois substantivos, em que o segundo constituinte, dependente do primeiro, especifica ou indica a função ou o tipo do primeiro, o segundo constituinte não flexiona. É um caso idêntico, por exemplo, a homem aranha (homens aranha) ou a personagem-tipo (personagens-tipo).