A forma correta e tradicional é Isaac, que tem uma variante também aceitável, Isac.
Isaque, embora tenha configuração portuguesa, levando a crer que até poderia ser preferível, é uma outra variante aceitável, mas que não parece ter tradição de uso significativa. Contudo, encontra-se em Portugal, fazendo até parte da atual lista de nomes admitidos pelo Instituto dos Registos e do Notariado.