A vírgula é, principalmente, um sinal de separação. Aqui vão devidamente virguladas as expressões apresentadas pelo nosso consulente:
a) Os alunos, por exemplo o João, ...
b) Os alunos, nomeadamente o João, …
c) Os alunos, máxime o João, ...
Para compreendermos melhor, completemos a primeira frase. As outras completam-se da mesma maneira.
Os alunos, por exemplo o João, são trabalhadores.
A expressão por exemplo o João está intercalada em "Os alunos são trabalhadores". Por isso, separa-se. Nas outras frases, a explicação é a mesma.