A locução conjuntiva alternativa ou disjuntiva quer... quer... pode ligar orações ou elementos da mesma oração. Se liga orações, usa-se com vírgulas, colocadas antes das duas ocorrências de quer:

(1) «De qualquer jeito, quer viaje de carro, quer [viaje] de avião, ele vai» (Dicionário Houaiss)¹

(2) «Quer chovesse, quer fizesse sol, tinha de sair.» (dicionário da Academia das Ciências de Lisboa)

Se liga elementos da mesma oração, é facultativo o emprego de vírgulas antes de qualquer uma das duas ocorrências de quer:

(3) «Chora quer de dor, quer de saudade» (Dicionário Houaiss)
(4) «O artigo abordava assuntos quer políticos quer sociais.» (dicionário da Academia das Ciências de Lisboa)
(5) «O problema para a Polícia é a presença externa, quer de grupos oriundos de várias cidades espanholas, quer de grupos oriundos do estrangeiro» (João Andrade Peres e Telmo Móia, Áreas Críticas da Língua Portuguesa, Lisboa, Editorial Caminho, 2003, pág. 443).

¹ A frase foi retirada do Dicionário Houaiss, que a dá como exemplo de conjunção alternativa que «liga orações do mesmo nível sintático, mantendo entre elas uma relação de alternância». Acrescentei entre parênteses rectos a forma verbal viaje, que não ocorre na segunda por elipse.

Cf. Queria? Já Não Quer? Mitos e Disparates da Língua Portuguesa