Os prontuários esclarecem que o prefixo pró- deve separar-se do radical que se segue por meio de hífen quando o seu significado é «a favor de». Ora, como não é esse o caso de pro- em "profármaco", que significará «à maneira de, em lugar de», poder-se-á escrever "profármaco", tal como pronome (e não "pró-nome").
Nos dicionários gerais de língua, o termo não está atestado. Mas o Dicionário de Termos Médicos de Manuel Freitas e Costa (Porto Editora, 2005) regista profármaco, sendo esta, portanto, a forma recomendável.
Ainda que se opte correntemente, por exemplo em textos que circulam na Internet, por "pró-fármaco", recomendo profármaco, pelas razões apontadas.