De facto, historicamente, as palavras sapato e salema eram grafadas com ç para indicar que estas palavras começavam com uma consoante africada (um som produzido com o bloqueio total do trato vocal a que se segue uma pequena abertura que produz uma ligeira fricção), mas que depois passou a predorsodental.
Já no século XX, com as reformas ortográficas, decidiu-se que não seria necessário escrever estas palavras com ç por serem em número reduzido as que o apresentavam em posição inicial.
Sempre ao seu dispor.