Se diz que o nome da cidade do estado brasileiro de Goiás passou a escrever-se Cassu, então é porque tal aconteceu muito recentemente: encontro a grafia Caçu num documento em linha datado de Novembro de 2008. Além disso, é Caçu a forma que ocorre no artigo sobre o gentílico caçuense no Novo Aurélio Século XXI:
«caçuense, Adj. 2g. 1. De, ou pertencente ou relativo a Caçu (GO). S. 2 g. 2. O natural ou habitante de Caçu.»
Caçu é também a grafia da entrada referente à cidade em apreço na Enciclopédia Luso-Brasileira de Cultura, da Editotial Verbo. E, finalmente, o Dicionário Onomástico Etimológico da Língua Portuguesa, de José Pedro Machado, regista Caçu, como topónimo de origem tupi existente em Goiás e Minas Gerais.
A hipótese da origem tupi de Caçu é sugerida no respectivo artigo da Wikipédia:
«Diz-se na cidade que o nome "Caçu" provém da planta [a]lcaçuz, que já foi bastante encontrada nas margens do rio que margeia a cidade, o rio Claro (Goiás). No entanto, o [a]lcaçuz é uma planta que só vive em regiões frias, então é impossível que tenha havido grandes quantidades desta planta em qualquer região do cerrado. Outra possível origem do nome é da expressão indígena "Caá-açu", que significa "Mato Grande".»
É plausível a origem tupi de Caçu, porque, no Dicionário Histórico das Palavras Portuguesas de Origem Tupi, de Antônio Geraldo da Cunha, o "Índice analítico dos Étimos Tupis" (págs. 321-334) inclui os elementos ka´a, «folha, mato, erva», e a´su, u´su ou üa´su,1 «grande». Estes elementos são detectáveis, respectivamente, em caatinga, «vegetação típica do Nordeste brasileiro e de parte do Norte de Minas Gerais», e no topónimo Nova Iguaçu (Iguaçu < ygwa'su, «rio grande»; ver Dicionário Houaiss, s.v. iguaçuano).2 Cabe ainda referir que existe o substantivo comum caaguaçu, com as variantes caá-açu e caaçu (idem), cuja etimologia, «tupi ka´a "mato, erva, planta em geral, mata" + tupi a´çu "grande, vasto, enorme, maior"» (ibidem), é precisamente a mesma sugerida a respeito de Caçu.
Quanto à origem francesa do topónimo, não sei qual tem sido a projecção dos indivíduos com o apelido|sobrenome Cassu na história de Goiás ou de Minas Gerais; mas será pouco provável se a fundação de Caçu tiver ocorrido durante o período colonial português. Contudo, posso adiantar que existe o nome Cassou (ver Enciclopédia Luso-Brasileira de Cultura, s.v. Cassou, Jean), que pode ser aportuguesado como "Cassu". Este apelido|sobrenome foi inicialmente um nome designativo, visto atestar-se em gascão, língua românica do Sudoeste da França, o substantivo comum cassou, «carvalho» (ver Dictionnaire Gascon-Français, do Abade Vincent Foix).
Finalmente, sobre o Caçu do romance mencionado na pergunta, nada posso afirmar por não ter acesso ao texto.
1 No original, a letra ü tem um sinal por baixo, semelhante ao que se vê em ų.
2 A transcrição do Dicionário Houaiss (DH) diverge da usada na obra de Antônio Geraldo da Cunha (AGC). Nos exemplos utilizados, yg (DH) = ü (AGC); ç (DH) = s (AGC).