Em Portugal, não é só em Lisboa que a palavra rio se pronuncia "riu" (como riu, 3.ª pessoa do singular do pretérito perfeito do indicativo do verbo rir). Por exemplo, nos Açores também se atesta a mesma pronúncia.
Quanto a ria, pronuncia-se esta palavra como dissílabo: "ri-a". Não há incoerência por parte dos lisboetas e de outros grupos de falantes quando assim pronunciam a palavra, porque só seria possível formar ditongo crescente se a sequência "ria" não recebesse acento tónico e fizesse parte de uma palavra esdrúxula; p. ex., gambérria (cf. Dicionário Houaiss; também seria legítimo considerar que a sequência -rria contém um hiato).
Note-se ainda que, ao contrário de rio, que permite a formação de um ditongo decrescente, iu, no qual o u é uma semivogal (cf. eu, mau), em ria não é possível a pronúncia de um ditongo decrescente, porque a não é uma semivogal, mesmo no português de Lisboa ou no das ilhas.