O verbo decorrer, no sentido em que é utilizado, significa «ser resultado de, ter origem em, derivar, provir». A preposição que se segue é a preposição de.

Em nosso parecer, a formulação de ambas as frases não está correcta. Na primeira frase, a forma verbal a utilizar deveria ser ocorrem, e não decorrem. Assim:

«Essas modificações ocorrem na sequência de alteração...»

Na segunda frase, para que a formulação esteja correcta, devemos omitir «na sequência». Assim:

«Essas modificações decorrem de alteração...»