A locução prepositiva «para com» equivale à expressão «em relação a». No caso presente, é a forma adequada, visto que «em falta para comigo» equivale a «(ele ou ela) está em falta em relação a mim».
A expressão «em falta comigo» contém alguma ambiguidade, porque podemos ser levados a pensar que «eu e ele estamos em falta», dado que a preposição «com» indica frequentemente a companhia.