Depois da preposição a, ocorre o pronome ti. Deve, portanto, dizer «a ti», e não «a te». Além disso, se a frase começa por um imperativo de 3.ª pessoa («apague») isso significa que a forma de tratamento usada é a de 3.ª pessoa.
Sendo assim, a frase mais correta, pelo menos, no português europeu, é a seguinte:
«Apague o cigarro antes que ele o apague a si.»
Uma alternativa em português do Brasil poderá ser:
«Apague o cigarro antes que ele apague você.»