Perante a ausência de contexto, é difícil dar resposta cabal a esta consulta...

A forma æquo (por vezes grafada aequo) é o dativo ou ablativo singular do adjetivo æquus, æqua, æquum (por vezes grafado aequus, aequa, aequum), que significa «igual; plano; cómodo, favorável, propício; equitativo, justo; conveniente, decoroso, decente». Pode igualmente considerar-se o dativo ou ablativo singular de æquum (também grafado aequum), que significa «equidade» e não é mais do que a forma neutra do adjetivo anterior, usada substantivamente.

Quanto a ne, trata-se de uma partícula que geralmente significa «que não», «para não», «para que não». Também poderia tratar-se da segunda pessoa do singular do imperativo do verbo neo («tecer»), mas não deverá ser esse o caso...

Portanto, o significado de ne æquo (ou ne aequo) dependerá obviamente do contexto. Encontrei a expressão, por exemplo, num discurso proferido por Friedrich Layriz em 1845, na cerimónia de encerramento do ano escolar de um liceu em Munique, na Alemanha:

«Ne æquo longius sermo protrahatur» («Para o discurso não se alongar mais do que o devido»).

Neste caso, æquo é o ablativo singular de æquum («equidade, o que é justo, o que é devido») e depende do comparativo longius («mais longo»).