Em português de Portugal, recomenda-se a pronúncia "busão" (cf. Grande Dicionário da Língua Portuguesa, da Porto Editora), uma vez que esse o se encontra em sílaba átona e fica assim sujeito à regra de neutralização do vocalismo átono. No entanto, a referida regra tem várias exceções atualmente, pelo que não é de admirar que ocorra também, sem que se possa considerar errada, uma variante com o aberto nessa posição átona — "bòsão" (a palavra continua aguda) —, aparentemente por analogia com protão, que apresenta o aberto em sílaba átona (ibidem).
No Brasil, preferem-se formas acentuadas na primeira sílaba: bóson, próton (cf. Dicionário Houaiss e iDicionário Aulete).