Nada em concreto se sabe sobre este nome. Segundo José Pedro Machado, no Dicionário Onomástico Etimológico da Língua Portuguesa, o apelido Ganito talvez esteja relacionado com o topónimo Ganita, verifica-se que ocorre na região de Serpa, no Alentejo, em Portugal (Machado, op. cit.), mas pouco mais se consegue adiantar: «Alc[unha] tornada topónimo? Qual? Se este top[ónimo] for moderno, será o nome do mineral ganite que lhe deu origem? E esse mineral existe na região? Ou será alteração de Ganilho?» (ibidem).