Não é incorrecto (é até necessário) o uso da vírgula nos casos que aponta, se à conjunção coordenativa copulativa e se seguir, por exemplo, uma oração intercalada. Atente na frase: «a conversa azedou e, disse-me ele, não ficou por ali». A vírgula é aqui obrigatória, e a continuidade do sentido não se perde pelo facto de a colocarmos depois da conjunção copulativa.
Há, no entanto, casos em que a vírgula é facultativa, e então não se deve "descoser" o discurso que tem um ritmo e uma unidade própria. Mas aí já estaremos perante uma questão de estilo, não de gramática.