Em princípio, qualquer dos modos se pode considerar correcto.
A locução latina «cogito, ergo sum», que significa «Penso, logo existo», é um aforismo de Santo Agostinho, tomado por Descartes no Discurso do Método*, constatação fundamental que serviu de base ao sistema cartesiano. Sempre a vi assim pontuada, só com uma vírgula, entre «penso» e «existo».
(«Je pense, donc je suis.»)