Devo antes de mais nada declarar que as afirmações têm como base o Acordo Ortográfico Luso-Brasileiro de 1945, ainda em vigor em Portugal.
1) Se a concordância é com pacientes, como penso, tem de ser anticorpo-positivos/negativos.
2) Recomenda-se musculoesquelético (embora o Dicionário Houaiss da Língua Portuguesa registe musculosquelético como variante)
3) Deve ser duplos-cegos e placebos-controlados.
4) Sem hífen. Não está ainda registado, ao contrário, p. ex., de bem-soante. A maior parte das vezes o advérbio bem ainda não forma vocábulo composto com o adjectivo ou particípio que se lhe segue.
5) Não é incorrecto nem obrigatório.
Ponto e vírgula não constituem um composto, pelo que o plural é pontos e vírgulas.
É preferível usar pontos e vírgulas, com a condição de não escrever com maiúsculas o que se lhes segue, e até sem traços ou travessões. Só o útlimo tem direito a ponto final.