Enquanto falante de língua portuguesa, aceito as duas frases como corretas.

No caso de «Cidadania não é apenas direitos e deveres», estamos perante a regra geral de concordância do verbo com o sujeito. No caso de «Cidadania não são apenas direitos e deveres», a concordância com o predicativo do sujeito pode ser explicada pelo facto de o verbo significar, na frase, «ser constituído por», situação em que, como refere Maria Helena de Moura Neves, na obra Guia de Uso do Português Confrontando Regras e Usos, p. 206, a concordância pode ocorrer com o predicativo do sujeito.