A questão da colocação do hífen depois de um pseudoprefixo (V. Respostas anteriores) não é pacífica, e nem todos os gramáticos e filólogos seguem as mesmas regras a tal respeito.
Na "Nova Gramática do Português Contemporâneo", Lindley Cintra e Celso Cunha listam e exemplificam pseudoprefixos, separando-os com hífen do segundo elemento, quando começado por vogal: auto-estrada, fono-estilística, macro-economia, geo-económico; mas fonovisão, fotonovela, macrobiótica, etc.
Parece-me ser esta a solução mais consentânea com os nossos hábitos ortográficos. Na minha opinião é, pois, agro-industrial, agro-alimentar, agro-indústria que se deve escrever, e agropecuária, agrometereologia, etc., quando a agro- não se segue vogal.