O verbo pôr ainda hoje é escrito com acento circunflexo. É assim que o distinguimos da preposição por.
Quanto a cor e flor, eram, de facto, grafadas com acento circunflexo num passado não muito distante1; mas, segundo o acordo ortográfico em vigor, actualmente não se deve usar o acento circunflexo nestas palavras.
1 N. E.: Antes do Acordo Ortográfico de 1945, escrevia-se côr para distinguir de cor em «aprender de cor». A grafia flôr está registada na 3.ª edição do Novo Dicionário da Língua Portuguesa de Cândido de Figueiredo, também antes da entrada em vigor do Acordo de 1945.