A palavra surge grafada sem acento, como Morgavel, e José Pedro Machado, no Dicionário Onomástico Etimológico da Língua Portuguesa, considera que é uma variante de Morganel. Tem origem desconhecida, a avaliar pelo que nos diz Machado:

«Sines (Moinho de Morganel). A terminação -el parece indicar tratar-se de forma meridional a que corresponderia Morganelo no Norte, de que não tenho notícias. [...]»

Em todo o caso, note-se que no Centro-Sul e no Sul de Portugal são frequentes os topónimos terminados em -el: Alportel (Faro), Ervidel (Beja), Beringel (Beja), Portel (Évora), Sousel (Portalegre), Turquel (Leiria). Alguns têm um radical reconhecivel (port- de porta em Alportel ou Portel; erved- de êrvedo, «medronheiro», em Ervidel), mas noutros, como Beringel, Turquel, Sousel e o topónimo Morgavel/Morganel, as etimologias são discutíveis.