«Fão1, top. Esposende; no Brasil: Rio Grande do Sul (povoação e rio). Como se confirmou em 1938 (...) este top. provém do lat. fanu-, "lugar sagrado", "templo" (...)
Fão2, apel. Ant. alc. De Fão1.»
In José Pedro Machado — Dicionário Onomástico Etimológico da Língua Portuguesa, Livros Horizonte.
Trata-se, portanto, de um apelido originado no top{#ó|ô}nimo, tal como acontece com os apelidos Braga, Leiria ou Lisboa, por exemplo.