Segundo José Pedro Machado (Dicionário Onomástico Etimológico da Língua Portuguesa), o {#apelido|sobrenome} Botas tem origem no plural do substantivo comum bota e encontra-se atestado desde 1402. Esta é também a forma que ocorre como topónimo em várias regiões de Portugal (Alcobaça, Armamar, Elvas, Felgueiras, Gouveia, Lagoa, Vila Franca de Xira), mas Machado (idem) não tem certezas sobre a relação de todos estes casos com bota.
Cabe então observar: sem excluir a hipótese de Botas se ter tornado apelido a partir de uma alcunha, mas sabendo que muitos apelidos têm origem em nomes de lugar (Gouveia, Melo, Lemos), talvez a ligação do apelido Botas a bota não seja assim tão segura, porque primeiro temos de considerar a origem do topónimo Botas. Além disso, haverá alguma afinidade com Boticas (Trás-os-Montes, Portugal)?