Maria João Freitas e Ana Lúcia Santos escreveram Contar (Histórias de) Sílabas, que pode ser um bom ponto de partida, pois para além de uma explicação rigorosa encontra aí referências bibliográficas interessantes. O endereço
http://mercurio.userworld.com/cgi/listagem_livraria_detalhe.pl?23 contém mais informações acerca desta obra.
Sónia Frota é uma das autoras do artigo sobre prosódia que integra a Gramática da Língua Portuguesa de Maria Helena Mira Mateus e outras, Editorial Caminho, 5.ª edição, 2003.
Ana Isabel Mata é outra investigadora desta área que poderá tentar contactar com proveito.
Bom trabalho!