Não tenho a certeza de ter percebido bem a sua pergunta: desacreditar como oposto de "não acreditar"...? Não será antes como oposto de "acreditar" (prefixo de oposição des- + acreditar)?
Bom, vejamos o que diz o Dicionário Houaiss a respeito desse verbo:
«1. fazer perder ou perder o bom-nome, a reputação; desabonar, descreditar 2. manter opinião depreciativa em relação a; desvalorizar 3. emitir conceitos desfavoráveis a respeito de; difamar, depreciar 4. possuir descrença em relação a 5. tornar(-se) indigno de crédito, fazer perder ou perder a boa reputação, a estima, a consideração desfrutada 6. infamar 7. pouco usado, não acreditar (em algum facto).»
Assim sendo, se tomar desacreditar como antónimo de acreditar, à luz da acepção 7 é possível, embora pouco usual, dizer «desacredito em Deus».