Exactamente. A frase que apresenta pode-se escrever de duas maneiras:

1) Se passares por minha casa, deixa lá a encomenda, senão (=caso contrário) trá-la contigo.

2) Se passares por minha casa, deixa lá a encomenda. Se não fores, trá-la contigo.

Em casos como este, também podemos escrever se não sem o verbo:

3) Se passares por minha casa, deixa lá a encomenda. Se não, trá-la contigo.

É aceitável a frase 3, porque se subentende o verbo: Se não [fores], trá-la contigo.

O facto de, na frase 3, pormos ponto final (ou ponto e vírgula) em «encomenda», leva-nos facilmente a subentender o verbo.

Nota - Nas duas frases a que se refere, não há duas opções, mas apenas uma, porque apenas escolhe uma delas. Peço desculpa de estas palavras não dizerem respeito à pergunta. Mas como não as disse por mal, mas por bem... sim... andamos cá neste mundo para nos ajudarmos uns aos outros... e esta nota foi uma ajuda. Desacerto semelhante é vulgaríssimo com a palavra alternativa. Um exemplo: O Pedro tem à escolha dois caminhos. Ou escolhe o caminho A ou o caminho B. A esta situação chama-se alternativa. Uma alternativa é, pois, «uma sucessão (e não duas) de duas coisas em que uma exclui a outra.» «É uma opção (e não duas) entre duas coisas.»