Lendo a resposta a uma pergunta colocada sobre a diferença entre Protista/Protoctista, que pode ser encontrada através da ligação:

http://www.ciberduvidas.com/php/resposta.php?id=4790 notei que a resposta dada não foi muito correcta.

Na realidade, todos os seres vivos podem ser distribuídos actualmente em cinco reinos: Animais, Plantas, Fungos, Monera e Protista.

Sem entrar em detalhes não relevantes, o facto é que se vieram a verificar limitações neste modelo inicial, e, em 1979, Whittaker, o seu autor, alterou-o de modo a incluir as Algas (que anteriormente estavam incluidas no Reino das Plantas) e fungos flagelados no Reino Protista. Isso implicou uma mudança nas características desse reino, que passou a incluir além de seres eucariontes unicelulares, também seres multicelulares, mas de diferenciação reduzida. Assim, alguns autores propõem a mudança do nome Protista para Protoctista, sendo o último o termo mais correcto e mais utilizado hoje em dia. Em suma, Protista e Protoctista significam exactamente a mesma coisa, e suponho que era essa a dúvida inicial de quem fez esta pergunta.